축적된 연구력의 결과로 신물질의 발견 빈도가 늘어나, 생물활성을 탐색하게 되어 “生藥으로부터 新藥開發”의 기반 조성을 다지게 된 시기이다. 1983년도에는 200평 규모의 연구동 증축도 이루어졌다. 전통약물에 대한 중요성이 인식되어 WHO는 본 연구소를 “전통약물연구 협력기관”으로 지정했다. 그러나, 뒤늦은 물질 특허의 도입으로 말미암아 이러한 발견들이 신약으로 실용화되는데 어려움을 겪었던 국내 여건에 좌절도 맛보아야 했다. 80년대는 自然科學大學, 農科大學 등에서도 천연물 연구를 활발히 시작한 시기 이기도 하다. 이러한 天然物의 연구의 확산은 生藥만을 연구하는 연구소가 아니라 天然色素, 天然農藥 등의 有用 天然物로 연구영역을 확대해야 하는 시대적 요청을 갖게 되었다. 그리하여 오늘의 天然物科學研究所로 확대 발전하는 계기를 맞이하고 여기에서 앞으로의 반세기를 기대하게 되었다. 또한 1988년 WHO로부 터 전통약물협력연구센터로 지정받아 동남아지역 관련연구센터와의 교류·연구협력을 활발히 하게 되었다.